[GALPon] Samba-4

Buenas; He montado una samba 4 en debian (estable) como PDC y funciona bastante bien (para ser una versión Alpha) , se administra desde un win con la consola de administración del 2003 (descargable desde la web de MS) y todo bien hasta que me propongo "pasar la información de un dominio al nuevo" (el que corre samba) en windows se hace con dcpromo pero el problema que me encuentro es que, el servidor de "origen" es un windows 2000 nativo que viene de un NT por lo cual en el momento de hacer la migración de NT a 2000 se modificaron las DNS para evitar el sufijo del dominio y poder pasar del NT a 2000, ¿que quiere decir esto? que yo me encuentro en samba 4 (al igual que en 2003 y 2008 de MS) con DOMINIO.local y en el windows 2000 con DOMINIO (sin sufijo)... por lo que no soy capaz de meter los dos servidores dentro de un mismo dominio y hay muy poca información de samba4 ¿álguien ha lidiado con algo similar? El objetivo es la migración de 200 máquinas a linux y estoy con pruebas y me decanté por SAMBA4 pero me da que está muy verde. La funcion de las máquinas en windows es la de autenticar usuarios y servidor de archivos cosa que se hace con samba 3, pero lo que me propongo es que el cambio sea lo mas transparente posible para la red que alimenta dicha máquina y automatizar el proceso lo máximo posible. ¿me he equivocado eligiendo Samba4?... un saludo y ¡espero buenas noticias! gracias Rafa T.