[GALPon] perl @ linux

Buenos días , he "recodificado" un programa en perl que nativamente funcionaba en Ruin2 con sus respectivas rutas (C:\....) lo que he hecho básicamente es modificar las rutas por las "nativas" de Linux (del tipo /home/...) y lanzarlo con el ejecutable de perl *perl programa.pl, *este programa contiene parámetros a la hora de ejecutarlo, es un ID y un nombre de archivo del tipo *perl programa.pl parametro1 parametro2 *pero cuando lo lanzo me dice que "parametro1" no lo encuentra (es un archivo de texto plano que contiene una cadena alfanumérica) lo hago como root y nada... si hago un "*cat*" del archivo con su ruta exacta me visualiaza el mismo.... el "chown" lo tengo a root:root en toda la estructura de carpetas , mi duda es si al lanzar perl usa el usuario root o si a esa ruta le tengo que dar otro tipo de permisos gracias!